Una técnica de PCR en tiempo real le permitió a Córdoba detectar la variante Ómicron en un viajero proveniente de Dubai días atrás. A los casos positivos, se les realiza otro hisopado. Esa muestra es sometida al análisis de variantes, mediante reactivos que detectan mutaciones específicas en cada una de ellas.
Todo lo publicado sobre la variante Ómicron
Los primeros casos del virus surgido en Sudáfrica se confirmaron mediante técnicas más completas, como secuenciaciones parciales o totales del genoma. Hoy, por la cantidad de casos y la velocidad de su diseminación, ya no hace falta identificar las más de 30 mil letras que conforman el ARN del virus para saber si estamos en presencia de Ómicron. La variante se detecta mediante esta técnica de PCR en tiempo real.
El primer caso de Ómicron en Córdoba se detectó en un viajero proveniente de Dubai. Al dar positivo, fue hisopado nuevamente. Y mediante estos reactivos específicos, los investigadores comenzaron a confirmar o descartar mutaciones. En un momento en que entre el 80 y el 90 por ciento de los casos eran Delta, llamó la atención que este caso no tenía las características propias que definían la variante de India.
Este en caso en particular mostraba una “deleción” (una característica particular del ARN) que era compatible con Alpha. Pero ésta, en ese momento, no circulaba en Córdoba. Los investigadores se dieron cuenta de que estaban en presencia de algo singular. Y entonces sometieron las muestras a una “secuenciación parcial”.
Es decir, se analiza una parte específica del genoma (800 pares de bases). Pero no cualquier parte, sino aquella que ha demostrado tener una mayor cantidad de mutaciones: la región que se ocupa de codificar la proteína de la espiga. Una región importante por ser la que media en el ingreso del virus a la célula y por iniciar el ciclo de infección.
“En esa región, Ómicron tiene 14 mutaciones. Sabíamos cuáles eran porque existe una base de datos del genoma. En la muestra del viajero de Dubai, las encontramos a todas. Pero, por ser la primera vez que detectábamos esa variante en Córdoba, necesitábamos mandarlas al Malbrán, para secuenciar el virus completo, identificar todas las letras que conforman el genoma”, explica Viviana Ré, investigadora del Instituto de Virología José Vanella de la Universidad Nacional de Córdoba, que coordina junto con María Belén Pisano el grupo de investigación de variantes en esa institución.
Antes de que el Malbrán confirmara la variante, ya se habían desplegado acciones en los contactos estrechos del viajero. En ese tiempo, aparecieron nuevos brotes en las fiestas de egresados. Hasta ahora, todos los casos de Ómicron tendrían el mismo patrón.
Los estudios de variantes no sólo permiten identificar qué está circulando en un determinado lugar sino también si esos casos tienen el mismo origen. Por ejemplo, los primeros diagnósticos positivos de Delta tenían características similares, lo que hace pensar que los casos se fueron diseminando en forma silente, quizás en forma asintomática, hasta conectarse la ciudad de Córdoba con Deán Funes.
Hasta el viernes pasado, todos los casos confirmados de Ómicron tenían un nexo identificado (se lo relacionaba con alguno de los brotes en curso). Lo que llama la atención es su rápida diseminación. Pero no se sabe hasta este momento si eso tiene que ver con una variante más transmisible o con el contexto actual, de mayores aperturas, mayor relajamiento en la población, más festividades y eventos masivos. También se desconoce si tendrá un mayor impacto en casos severos, hospitalizaciones y muertes.
El hospital Rawson, centro de referencia, está experimentando un aumento en la consulta de pacientes con síntomas respiratorios. Y, aunque con una suba más leve, también crecen las internaciones por Covid-19. La información fue confirmada por Miguel Díaz, director de la institución.
Recientemente, la Fundación para el Progreso de la Medicina recibió reactivos del Malbrán. Este nodo de Córdoba se sumará al resto de laboratorios que pueden secuenciar el genoma completo.
